Guía completa sobre los impuestos para PYMES en España

Gestionar una PYME en España implica tomar decisiones constantes: ventas, personal, proveedores, cobros… Pero hay un elemento que no puede descuidarse en ningún caso: las obligaciones fiscales. Para muchas PYMES, la gestión fiscal trimestral es una fuente constante de estrés, no por falta de voluntad, sino por falta de sistema. Conocer qué impuestos debe presentar tu PYME cada trimestre es solo el primer paso. Si tienes o quieres crear una empresa, deberás conocer qué impuestos paga una empresa en España.

Las obligaciones con Hacienda son numerosas en el sistema tributario español, y en algunos casos varían según comunidades autónomas. La fiscalidad de las PYMES se refiere a las obligaciones impositivas de las pequeñas y medianas empresas con el estado español. No cumplir con las obligaciones fiscales trimestrales no es una cuestión menor. La Agencia Tributaria aplica un sistema de control automatizado que detecta con facilidad retrasos, omisiones o inconsistencias en las declaraciones.

En este artículo aprenderás qué impuestos deben pagar las empresas españolas, cómo gestionarlos y algunas recomendaciones clave para optimizar tu fiscalidad.

Clasificación de los Impuestos para Empresas en España

En España, podemos diferenciar los impuestos destinados a gravar a las empresas en dos tipos principales: impuestos directos e indirectos. Además, encontramos otras tres clasificaciones relativas a la distribución u organización territorial.

Impuestos Directos e Indirectos

• Impuestos directos: Son aquellos que gravan la posesión o generación de riqueza, es decir, las empresas pagan por lo que tienen en caja o han ingresado.
• Impuestos indirectos: Son aquellos que gravan el consumo, es decir, del uso que se hace con esa riqueza generada.

Clasificación Territorial

• Impuestos estatales: Principalmente, el Impuesto sobre Actividades Económicas (IAE), el Impuesto sobre Sociedades (IS) y el Impuesto sobre el Valor Añadido (IVA).
• Impuestos autonómicos: Varían por región y las autonomías pueden crear impuestos propios, que no deben gravar en ningún caso hechos imponibles que ya están sometidos a los estatales. En algunos casos, existen competencias compartidas. Por ejemplo, la ley que regula los impuestos locales es estatal y en otros impuestos coexisten unas normas estatales y otras autonómicas o locales. De una manera u otra, el Estado suele intervenir en los tributos más importantes. Por tanto, en aquellos en los que participan las comunidades, suele existir un reparto de competencias y recaudación.
• Tributos locales: Impuestos, tasas y contribuciones. Las entidades locales (municipios, provincias e islas) no pueden aprobar normas con rango de ley. Por tanto, lo normal es que estén establecidos por la Ley Reguladora de las Haciendas Locales. Esta puede dejar margen para que cada entidad local tenga la posibilidad, en su desarrollo, de aprobar reglamentos que incidan sobre algunos aspectos de los impuestos locales.

Tipos de Impuestos para Empresas según Categoría

Ahora que podemos diferenciar entre estas dos categorías, podemos resumir todos los impuestos que gravan a las empresas:

• Impuestos directos estatales: Impuesto sobre la Renta de las Personas Físicas o IRPF (solo para autónomos); Impuesto sobre Sociedades (IS).
• Impuestos indirectos estatales: Impuesto sobre el Valor Añadido (IVA); aduanas e impuestos especiales de gestión estatal.
• Impuestos directos de las comunidades autónomas: Impuesto sobre Sucesiones y Donaciones.
• Impuestos indirectos de las comunidades autónomas: Impuesto sobre Transmisiones Patrimoniales y Actos Jurídicos Documentados; impuestos especiales de gestión autonómica.
• Impuestos directos locales: Impuesto sobre Actividades Económicas (IAE); Impuesto sobre Bienes Inmuebles (IBI); Impuesto sobre Vehículos de Tracción Mecánica (IVTM); impuestos sobre construcciones y obras.
• Impuestos indirectos locales: Impuesto sobre el Incremento de Valor de los Terrenos de Naturaleza Urbana; tasas y licencias.

Principales Impuestos que Afectan a las PYMES

1. Impuesto sobre el Valor Añadido (IVA)

El Impuesto sobre el Valor Añadido (IVA) es un impuesto indirecto que grava el consumo de bienes y servicios. Tanto ciudadanos como empresas tienen que pagar este impuesto, pues grava el consumo de bienes y servicios. Precisamente por eso es un poco complejo, a pesar de ser el más conocido. Las empresas actúan como agentes recaudadores para Hacienda, repercutiendo el IVA en sus facturas. El IVA se aplica en Península y Baleares, y en las islas Canarias cuentan con un impuesto que sustituye al IVA: el Impuesto General Indirecto Canario (IGIC).

Tipos Impositivos del IVA

En España, existen varios tipos impositivos de IVA que se aplican a las actividades de las PYMES, dependiendo del tipo de bienes o servicios que ofrezcan:

• IVA general (21 %): Este es el tipo impositivo estándar y se aplica a la mayoría de los bienes o servicios en España.
• IVA reducido (10 %): Se aplica a determinados bienes y servicios considerados de primera necesidad o de interés social.
• IVA superreducido (4 %): Es el tipo impositivo más bajo y se aplica a bienes y servicios de primera necesidad.

Obligaciones de las PYMES relacionadas con el IVA

Las PYMES en España tienen ciertas obligaciones relacionadas con el registro, la declaración y el pago del IVA. Estas obligaciones son fundamentales para cumplir con la normativa fiscal y evitar posibles sanciones por parte de la Agencia Tributaria.

• Registro en el censo de empresarios, profesionales y retenedores: Antes de comenzar cualquier actividad empresarial o profesional sujeta al IVA, las PYMES deben registrarse en el censo de la Agencia Tributaria.
• Facturación: Las PYMES deben emitir facturas por las operaciones sujetas al IVA.
• Liquidación periódica del IVA: Las PYMES están obligadas a presentar declaraciones periódicas de IVA ante la Agencia Tributaria. Estas declaraciones suelen ser mensuales o trimestrales, dependiendo del volumen de facturación y otras circunstancias específicas. Cada mes o trimestre, según corresponda, las empresas deben liquidar en Hacienda la diferencia entre el IVA repercutido (el que aplican a sus clientes en las facturas) y el IVA soportado (el que pagan a los proveedores reflejado en sus correspondientes facturas).
• Autoliquidación del IVA: En la declaración periódica de IVA, las PYMES deben autoliquidar el impuesto, es decir, calcular la diferencia entre el IVA recaudado y el IVA soportado y pagar el saldo resultante a la Agencia Tributaria.

Modelos de Declaración del IVA

Para declarar el IVA, lo haremos a través de los siguientes modelos:

• Modelo 303: Uno de los más importantes es el modelo de autoliquidación del IVA trimestral, donde se informa del IVA que se ha cobrado a los clientes y se ha pagado a los proveedores, por tanto, es la diferencia entre el IVA de compras y el IVA de ventas. Lo debe presentar cualquier empresario o profesional que desarrolle actividad sujeta a IVA.
• Modelo 390: El resumen anual del Modelo 303.

2. Impuesto sobre Sociedades (IS)

El Impuesto sobre Sociedades (IS) es un tributo que grava la renta de las sociedades y otras entidades jurídicas residentes en España. Se aplica sobre los beneficios obtenidos por estas entidades en un determinado período fiscal. Es un impuesto directo, equiparable al IRPF, pero dirigido a las empresas. Todas las empresas que residan en nuestro país, o bien se crearon en España, o bien tienen la sede o domicilio social aquí, están obligadas a pagar el Impuesto de Sociedades (IS).

Base Imponible y Tipos Impositivos del IS

• Base imponible: La base imponible del IS se determina a partir del resultado contable ajustado. El resultado contable se obtiene de los estados financieros de la empresa, pero luego se realizan una serie de ajustes y correcciones fiscales permitidas por la normativa fiscal para calcular la base imponible fiscal.
• Tipos impositivos: En España, existen diferentes tipos impositivos aplicables al Impuesto sobre Sociedades, que pueden variar según el tamaño y la naturaleza de la empresa.
  • Un tipo general del 25 %.
  • En 2026, el tipo general para PYMES (1-10 millones €) es del 23 %. Para micropymes (< 1 millón €), se aplica un sistema progresivo: 21 % primeros 50.000€ y 22 % resto (declaración anual); o 19 % primeros 50.000€ y 21 % resto (pagos fraccionados).
  • Se mantiene el 15 % para empresas de nueva creación o cooperativas fiscalmente protegidas.
  • Además, en 2026 se consolida el Impuesto Complementario, que garantiza un nivel mínimo global de imposición del 15 % para los grandes grupos multinacionales y nacionales con cifra de negocio ≥ 20 millones de euros.

Deducciones del Impuesto sobre Sociedades

• Deducción por actividades de investigación y desarrollo (I+D): Las empresas que realicen actividades de I+D pueden deducir un porcentaje de los gastos e inversiones realizados en proyectos de investigación y desarrollo.
• Deducción por actividades de innovación tecnológica: Las empresas que realicen actividades de innovación tecnológica pueden deducir un porcentaje de los gastos e inversiones realizados en este ámbito.

Modelos de Declaración del IS

Para declarar el IS, lo haremos a través de los siguientes Modelos:

• Modelo 200: Es el modelo que sirve para la declaración del Impuesto sobre Sociedades e Impuesto sobre la Renta para no residentes.
• Modelo 202: Este modelo sirve para hacer el pago fraccionado del impuesto de sociedades. Este impuesto se declara anualmente, aunque el pago se realiza de forma fraccionada a lo largo de tres plazos durante el ejercicio.
• Modelo 220: Este modelo se dirige a aquellos grupos de sociedades que cumpliendo la definición de grupo fiscal recogida en el artículo 67 del TRLSA, opten por aplicar este régimen de tributación.

3. Impuesto sobre Actividades Económicas (IAE)

El Impuesto sobre Actividades Económicas (IAE) grava la actividad económica de personas físicas y jurídicas. Se aplica por el mero hecho de ejercer una actividad empresarial, profesional o artística. Es un impuesto directo que grava la obtención de beneficios por parte del autónomo o del empresario. El IAE se abona de manera anual. Es un impuesto municipal pero de gestión compartida con el Estado.

Obligatoriedad y Exenciones del IAE

El IAE es obligatorio para empresas con facturación superior a 1 millón de euros anuales; aquellos autónomos o empresas cuyo volumen neto de negocio esté por debajo del millón de euros están exentos de pagar el IAE. Esté exenta o no, la empresa o el autónomo deben darse de alta en el IAE utilizando los modelos 036 o el modelo 037. La tarifa del IAE puede depender de la naturaleza de la actividad económica de tu empresa, del número de empleados, o ser progresiva en función del volumen de negocio o los ingresos.

En nuestro blog puedes encontrar el listado de epígrafes del IAE en función de la actividad. Este es uno de los factores que determina la retención de IRPF que autónomos y empresas deben aplicar en sus facturas.

4. Impuesto sobre la Renta de las Personas Físicas (IRPF)

El Impuesto sobre la Renta de las Personas Físicas (IRPF) grava las rentas obtenidas en un año. Está relacionado con las personas -todos los residentes en España- y no con las empresas (sí con los autónomos). Se aplica a trabajadores y autónomos. En el caso de estos últimos, tienen que llevar a cabo una liquidación trimestral, según los modelos 130 -para aquellos que realicen actividades económicas en estimación directa- o el 131 -en el caso de tributar por estimación objetiva, también conocida como módulos-. Además, hay que realizar una liquidación anual, el conocido como modelo 100, que también deben hacer los trabajadores. La campaña suele comenzar sobre el mes de abril y la fecha límite de presentación es a finales de junio.

Aunque las PYMES no pagan IRPF directamente, sí tienen la obligación de retenerlo y declararlo. Las empresas y autónomos han de retener en sus facturas un 15 % (un 7 % en los dos primeros años de actividad) y declarar este IRPF retenido.

Modelos de Declaración del IRPF retenido por empresas

Para ello, tienen que declarar su IRPF retenido con estos dos modelos:

• Modelo 111: Para retenciones en nóminas o en las facturas de profesionales.
• Modelo 115: Para retenciones en el pago de facturas de alquiler de inmuebles.

5. Impuestos Regionales y Locales

La fiscalidad autonómica en nuestro país contaba con 85 impuestos propios en 2021, 3 más que el ejercicio anterior. Esto supone un quebradero de cabeza para los empresarios, además de una barrera para la inversión exterior. En el ámbito local, los impuestos que deben abonar las empresas aparte del IAE, giran en torno a estos cuatro grupos:

• Impuesto sobre vehículos de tracción mecánica (IVTM): para vehículos de empresa.
• Impuesto por construcciones y obras (ICIO): se aplica en caso de realizar obras.
• Impuesto sobre bienes inmuebles (IBI): para inmuebles en propiedad. Es un tributo que paga anualmente el propietario de una vivienda, garaje, local comercial o finca rústica o urbana al ayuntamiento.
• Tasas municipales: licencias de apertura, agua, luz, residuos urbanos, etc.

6. Impuestos Especiales y Medioambientales

En nuestro país existe una categoría llamada impuestos especiales y que tienen que ver, por ejemplo con el gravamen destinado a la importación, fabricación y/o introducción en el territorio español de determinadas actividades (alcohol y bebidas alcohólicas e hidrocarburos), así como la matriculación de determinados puestos de transporte, el suministro de energía eléctrica y la puesta a consumo de carbón.

Por otro lado, en España también existen impuestos medioambientales, que tienen como objetivo avanzar hacia una economía verde y contribuir a las necesidades del planeta:

• Impuesto sobre la producción y almacenamiento de combustible nuclear y residuos radiactivos.
• Impuesto sobre el valor de la extracción de gas, petróleo y condensados.
• Impuesto sobre el valor de la producción de la energía eléctrica.
• Impuesto sobre los gases fluorados de efecto invernadero.

7. Cotizaciones a la Seguridad Social

Por último, tenemos que tener en cuenta las cotizaciones a la Seguridad Social. Según un estudio, cada euro que acaba en las manos de los trabajadores en concepto de sueldo, les cuesta a las empresas 1,69 €. En esa cantidad se incluyen 0,41 euros por aportaciones a la Seguridad Social, 0,20 euros en el Impuesto sobre la renta de las Personas Físicas (IRPF) y otros 0,09 euros por la aportación del empleado a la Seguridad Social. En resumidas cuentas, las cotizaciones a la Seguridad Social ocupan una buena parte de lo que una empresa debe destinar al pago de sus impuestos generales.

Modelos Tributarios Anuales Adicionales

En España tenemos otros Modelos Tributarios, aparte de los ya comentados, muy importantes para las empresas. Regulación de alquileres, de operaciones intracomunitarias, y otras acciones de las cuales la Agencia Tributaria exige notificación.

Te explicamos los más importantes a tener en cuenta:

• Modelo 180: Es el Modelo anual del 115.
• Modelo 190: Es el Modelo anual del 111.
• Modelo 347: Modelo informativo de carácter anual que sirve para informar de la suma de operaciones realizadas con un cliente o proveedor superiores a 3005,06€.
• Modelo 349: Que necesitarás en caso que tu empresa realice operaciones intracomunitarias, es decir, servicios, entregas o adquisiciones que se realizan fuera de España, pero dentro de la Unión Europea.

Sanciones por Incumplimiento Fiscal

No cumplir con las obligaciones fiscales trimestrales no es una cuestión menor. La Agencia Tributaria aplica un sistema de control automatizado que detecta con facilidad retrasos, omisiones o inconsistencias en las declaraciones.

• Si presentas el modelo fuera de plazo, pero antes de que Hacienda te lo reclame, se aplicará un recargo del 1 % fijo, más un 1 % adicional por cada mes completo de retraso (hasta los 12 meses).

Si detectas un error, puedes presentar una declaración complementaria o rectificativa para corregirlo antes de que Hacienda lo detecte. Recomendación clave: No esperes a que llegue una notificación.

Optimización Fiscal para PYMES

Las PYMES en España pueden mejorar su situación fiscal mediante estrategias específicas. Esto incluye aprovechar las deducciones fiscales disponibles, como las relacionadas con gastos comerciales, inversiones en activos fijos y contratación de personal. Además, es fundamental explorar los incentivos fiscales ofrecidos por el gobierno español, como créditos fiscales o exenciones de impuestos para actividades específicas, como la inversión en innovación o la contratación de empleados. La optimización de la estructura empresarial y una planificación cuidadosa de los ingresos y gastos también son clave para reducir la carga fiscal.

Diferentes normas tributarias establecen regímenes distintos para las empresas en función de su tamaño. Las órdenes ministeriales que regulan los modelos suelen establecer que las grandes compañías los presenten con más frecuencia. En el IVA, existe un Suministro Inmediato de Información (SII) al que están sujetas todas las grandes empresas, pero solo algunas PYMES. Además de liquidar todos los meses el IVA, mediante el modelo 303, implica que los sujetos al SII deben remitir en pocos días sus facturas a Hacienda. En el Impuesto sobre Sociedades, existe un régimen de incentivos para las empresas de reducida dimensión. En todo caso, hay que recordar que, en general, cuando una norma tributaria quiere regular un régimen específico establece los criterios para considerarla dentro de las grandes o las pequeñas.

Consejos para una Gestión Fiscal Eficiente

Para muchas PYMES, la gestión fiscal trimestral es una fuente constante de estrés. No por falta de voluntad, sino por falta de sistema. Aquí te dejamos algunas recomendaciones para cumplir de manera eficiente y efectiva con tus obligaciones tributarias:

• Lleva la contabilidad al día: No esperes al final del trimestre para ordenar facturas. Mantén un registro preciso de tus ingresos y gastos. Esto te ayudará a calcular los impuestos adecuadamente y a presentar tus declaraciones.
• Digitaliza tus documentos: Utiliza herramientas para escanear y clasificar facturas, tickets y justificantes. Es enormemente importante llevar una contabilidad y gestionar y almacenar correctamente las facturas de ingresos y gastos.
• Establece un calendario fiscal interno: Aunque Hacienda publica el calendario fiscal anual, conviene integrarlo en tu planificación mensual para evitar imprevistos. Presenta las declaraciones fiscales a tiempo.
• Planificación fiscal: Una parte del éxito de una compañía reside en su planificación fiscal. Para ello es imprescindible conocer qué impuestos paga una empresa en España y cumplir con los plazos establecidos.
• Consulta con un contable o asesor fiscal: Es recomendable consultar con un contable o asesor fiscal para determinar las obligaciones tributarias que se deben cumplir; así como obtener el asesoramiento especializado para realizarlas correctamente. Externalizar la gestión fiscal en una asesoría especializada te permite olvidarte de plazos, modelos y recargos.
• Aprovecha las herramientas tecnológicas disponibles: Automatiza procesos para presentar los modelos de Impuestos del IS, IVA, IRPF o cualquier otro impuesto de manera automática, sin tener que rellenar manualmente los modelos.
• Mantenerse informado: Sobre las últimas modificaciones y cambios en la legislación tributaria española.

En definitiva, la fiscalidad puede presentar desafíos para las PYMES, pero con conocimientos adecuados y una gestión tributaria eficiente, es posible cumplir con las obligaciones fiscales y aprovechar las oportunidades para optimizar la situación financiera de la empresa.