Impuestos para PYMES en España: Guía Completa

Tener una buena idea es la base de toda nueva empresa, después llega la gestión y lo mejor es estar al día de todo lo que pueda afectar a tu negocio. Por ejemplo, ¿qué tipo de impuestos has de pagar? Conocer qué impuestos paga una pyme es fundamental para evitar sanciones, planificar correctamente la tesorería y aprovechar los beneficios fiscales disponibles.

Antes de responder, hay que puntualizar que los impuestos que paga una empresa dependerán del tamaño de tu empresa. En términos generales, los impuestos para una pyme se centran en tres grandes tributos: IVA, Impuesto de Sociedades e Impuesto de Actividades Económicas (IAE).

Impuestos Comunes para Todas las Empresas

Todas las empresas tienen un impuesto común: el IVA, que opera de la misma forma independientemente del tamaño de la entidad. Pero existen otros tres impuestos que sí que dependen de cuántos trabajadores tenga la empresa: el Impuesto de Sociedades, los impuestos regionales y locales y las cotizaciones a la Seguridad Social.

Impuesto sobre el Valor Añadido (IVA)

El Impuesto sobre el Valor Añadido (IVA) es un impuesto indirecto que se aplica sobre el consumo de bienes y servicios en España. Este impuesto se paga en cada etapa de la producción y distribución de bienes y servicios, calculándose sobre el valor añadido que se genera en cada fase. Aunque lo abona el consumidor final, la empresa actúa como recaudadora para la Agencia Tributaria.

En España, existen varios tipos de IVA que se aplican según el tipo de bien o servicio que se esté vendiendo:

• 21% IVA general: Aplicable a la mayoría de productos y servicios.
• 10% IVA reducido: Que se aplica a productos sanitarios, alimenticios, agrícolas, ganaderos, forestales y de transporte.
• 4% IVA superreducido: Destinado a bienes de primera necesidad.

Las empresas obligadas a pagar el IVA deben presentar una declaración trimestral utilizando el modelo 303. Esta declaración incluye información sobre las operaciones realizadas durante el trimestre, como ventas y compras, y el cálculo del IVA a pagar.

Impuesto sobre Sociedades (IS)

El Impuesto sobre Sociedades (IS) es un impuesto directo que se aplica sobre la renta de las sociedades y entidades jurídicas que desarrollan actividades económicas en España. El tipo de gravamen que pagan las PYMEs en concepto de Impuesto de Sociedades en España es actualmente del 25%, pero puede verse reducido al 15% para las entidades de reciente creación que tengan una actividad económica.

El Impuesto de Sociedades general es del 25% y está vigente desde el día 1 de enero de 2016. Es necesario puntualizar que varía dependiendo de los tipos reducidos, especialmente si consideramos los casos de los emprendedores (empresas con menos de dos años de existencia), las cooperativas, las pymes y las microempresas.

De hecho, desde 2015 existen dos tipos reducidos del 15% para emprendedores, ya que el tipo preferente aplicable a este tipo de sociedades se fija en 10 puntos menos que el general durante dos años. En este caso en concreto quedan excluidas las sociedades patrimoniales.

Impuesto sobre Actividades Económicas (IAE)

El IAE grava el ejercicio de actividades empresariales, profesionales o artísticas. El importe a pagar varía según la actividad y el epígrafe en el que se encuentre inscrita la empresa.

Existen exenciones importantes:

• Pymes que facturen menos de un millón de euros.
• Empresas que hayan iniciado su actividad hace dos años o menos.

Por tanto, no todas las empresas están obligadas a pagarlo, pero sí a darse de alta en el censo de actividades.

Impuestos Regionales y Locales

En España, los impuestos regionales y locales varían con gran frecuencia. Por ejemplo, el País Vasco y Navarra son las autonomías en las que las empresas destinan un mayor porcentaje de su margen bruto a impuestos.

Las pymes tributan más de la mitad de lo que ganan (entre el 50,31% y el 50,97%), mientras que las grandes empresas pagan impuestos de más del 63% del margen bruto.

Cotizaciones a la Seguridad Social

En el pago de las cotizaciones a la Seguridad Social se incluyen más de tres cuartas partes del total de los impuestos de las empresas. En el caso de las pymes, estos impuestos representan el 78% y para las grandes empresas el 92%. La principal consecuencia es que el Impuesto de Sociedades se reduce en comparación al total que tiene que pagar una empresa.

En el caso de las pymes, este impuesto representa un 7%; mientras que en el de las grandes empresas asciende hasta un 16%.

Tabla Resumen de Impuestos para PYMES en España

Novedades Fiscales para PYMES en 2025

El año 2025 trae consigo cambios significativos en la normativa fiscal que afectan de manera directa a las pequeñas y medianas empresas (PYMES). El nuevo marco tributario incorpora incentivos y deducciones que buscan no solo reducir la carga impositiva, sino también fomentar la innovación, la inversión y el crecimiento sostenible de los negocios.

Todos los negocios, según explica la Agencia Tributaria, podrán optar a esta reducción y pagar un 15 % en el primer año en el que hayan obtenido resultados positivos y en el siguiente. Por lo tanto, la medida beneficia a las empresas que hayan tenido, por primera vez, un resultado positivo en 2023.

Otra ventaja para las empresas emergentes estriba en que, según la Agencia Tributaria, durante los dos primeros ejercicios en los que la base imponible es positiva, la empresa puede retrasar los pagos del Impuesto sobre Sociedades sin necesidad de garantías y sin generar intereses. En este caso, el aplazamiento puede ser de doce meses para el impuesto del primer ejercicio y de seis meses para el segundo.

La Importancia de un Programa de Contabilidad para PYMES

Llevar la contabilidad de una pyme de forma organizada y precisa es clave para determinar correctamente qué impuestos tiene que pagar una pyme y cumplir con las obligaciones fiscales sin errores ni sanciones. Muchos programas se actualizan de forma automática con los cambios legales, algo especialmente importante en un contexto como el de 2025, donde se han introducido nuevas medidas fiscales.

Al tener un control detallado de los movimientos financieros, es más fácil identificar deducciones y beneficios fiscales aplicables, reduciendo así la carga impositiva total.

Para tener todos los impuestos bajo control en la facturación de tu empresa, lo ideal es contar con un software que te permita tenerlo todo en un mismo lugar.

Modelos de Impuestos Comunes

• Modelo 111: retenciones de IRPF.
• Modelo 115: retenciones por alquileres.
• Modelo 200: liquidación del Impuesto de Sociedades y del Impuesto de la Renta de No Residentes.
• Modelo 303: autoliquidación del IVA.
• Modelo 347: operaciones con terceros (clientes o proveedores) por cantidades superiores a 3.005,06 euros anuales.
• Modelo 349: operaciones dentro de la Unión Europea.